Il tema Nintendo DSi divide le icone in pagine con un massimo di 40 icone per pagina. È possibile navigare tra le pagine utilizzando i grilletti e .
Premere sulla pagina più a sinistra ti porterà alla prima icona della pagina
Premere sulla pagina più a destra ti porterà all'ultima icona della pagina
La barra di scorrimento in basso rappresenta tutte le icone di una pagina in modo da poterla premere per spostarsi rapidamente in una posizione specifica della pagina.
Se i grilletti non funzionano, è possibile utilizzare SELECT + invece.
TWiLight Menu++ supporta la visualizzazione di foto personalizzate sullo schermo superiore, proprio come il Menù del Nintendo DSi. Tuttavia, invece di utilizzare quelle dell'applicazione "Fotocamera Nintendo DSi", è possibile inserire qualsiasi immagine PNG in sd:/_nds/TWiLightMenu/dsimenu/photos
Se la dimensione dell'immagine è inferiore al massimo, sarà centrata con dei bordi neri.
Premere SELECT nel tema Nintendo DSi farà apparire il menu DS classico per impostazione predefinita. Tuttavia, nelle impostazioni di TWiLight Menu++, è possibile modificarlo per avviare il menu SELECT, un menu in miniatura incorporato all'interno del tema stesso. Ecco le opzioni di menu per il menu SELECT.